BigWig is 'n lêerformaat vir vertoon van digte, deurlopende data in 'n genoomblaaierbaan, geskep deur omskakeling vanaf Wiggle (WIG)-formaat. BigWig-formaat word op die UCSC Genome Bioinformatics-webwerf beskryf, en die Broad Institute-lêerformaatgids verskaf bykomende inligting.
Wat is bigWig-formaat?
Die bigWig-formaat is vir die vertoon van digte, deurlopende data wat as 'n grafiek vertoon sal word BigWig-lêers word aanvanklik van WIG-tipe lêers geskep, met behulp van die UCSC-program wigToBigWig. Alternatiewelik kan bigWig-lêers vanaf bedGraph-lêers geskep word, deur die UCSC-program bedGraphToBigWig te gebruik.
Hoe gebruik ek bigWig-lêer?
Skuif die nuutgeskepte bigWig-lêer (myBigWig.bw) na 'n webtoeganklike http-, https, of ftp-ligging. Plak die URL in die pasgemaakte snit-inskrywingsvorm of bou 'n pasgemaakte snit met 'n enkele snitlyn. Plak die gepasmaakte snitlyn in die tekskassie op die gepasmaakte snitbestuurbladsy.
Wat is 'n bigWig-snit?
bigWig Tracks is spore vir deurlopende seine oor die hele genoom. Hulle is geskik vir die vertoon van verskeie "rou" eksperimentresultate soos ChIP-Seq-seine, RNA-Seq-seine, ens.
Hoe skep ek 'n bigWig-lêer?
Daar is verskeie maniere om grootkoplêers te genereer. Dit behels gewoonlik die omskakeling van 'n. bam-lêer na 'n wiggle track (. wig) en dan die wiggle track omskep in 'n binêre bigwig (.
