BLAST is 'n rekenaaralgoritme wat aanlyn beskikbaar is by die Nasionale Sentrum vir Biotegnologie-inligting (NCBI) se webwerf, sowel as baie ander werwe. BLAST kan 'n navraag-DNA-volgorde vinnig in lyn bring en vergelyk met 'n databasis van reekse, wat dit 'n kritieke hulpmiddel maak in deurlopende genomiese navorsing.
Is BLAST 'n primêre databasis?
BLAST is die sagteware wat die meeste in bioinformatika-navorsing gebruik word. Die hooffunksie daarvan is om 'n reeks van belangstelling, die navraagvolgorde, te vergelyk met reekse in 'n groot databasis BLAST rapporteer dan die beste passings, of "treffers", wat in die databasis gevind word. Hierdie eenvoudige program het twee primêre toepassings.
Is NCBI 'n databasis?
Die NCBI huisves 'n reeks databasisse wat relevant is vir biotegnologie en biomedisyne en is 'n belangrike hulpbron vir bioinformatika-instrumente en -dienste. Belangrike databasisse sluit in GenBank vir DNA-volgordes en PubMed, 'n bibliografiese databasis vir biomediese literatuur. Ander databasisse sluit die NCBI Epigenomics-databasis in.
Is BLAST net in NCBI-databasisse gebruik?
BLAST is beskikbaar op die web op die NCBI-webwerf. Verskillende tipes BLASTs is beskikbaar volgens die navraagreekse en die teikendatabasisse.
Hoe werk die BLAST-databasis?
Hoe werk BLAST? BLAST identifiseer homoloë rye deur gebruik te maak van 'n heuristiese metode wat aanvanklik kort passings tussen twee rye vind; dus neem die metode nie die hele ryruimte in ag nie. Na aanvanklike wedstryd probeer BLAST om plaaslike belynings vanaf hierdie aanvanklike wedstryde te begin.
