Veelvuldige volgordebelynings verskaf meer inligting as paarsgewyse belynings, aangesien hulle bewaarde streke binne 'n proteïenfamilie toon wat van strukturele en funksionele belang is.
Wat is die doel daarvan om 'n meervoudige volgorde-belyning uit te voer?
Gegewe 'n stel biologiese volgordes (RNA, proteïene, DNA), is die doel van 'n MSA-metode om die rye in lyn te bring op 'n manier wat óf hul evolusionêre, funksionele óf strukturele verwantskap sal weerspieël(Figuur 1).
Hoe help veelvuldige volgordebelyning in evolusie?
Belynde rye word vir baie doeleindes gebruik, insluitend skatting van patrone van divergensie, seleksie, die tempo en modus van evolusionêre verandering, identifikasie van funksionele elemente en beperkings, en filogenetiese geskiedenis, om net 'n paar te noem.
Is meervoudige volgorde-belyning?
Multiple Sequence Alignment (MSA) is gewoonlik die belyning van drie of meer biologiese volgordes (proteïen of nukleïensuur) van soortgelyke lengte Van die uitset kan homologie afgelei word en die evolusionêre verwantskappe tussen die reekse wat bestudeer is. … Baie vinnige MSA-instrument wat op plaaslike streke konsentreer.
Hoe word veelvuldige volgordebelyning gegenereer?
Die Clustal Omega-algoritme produseer 'n meervoudige volgorde-belyning deur eerstens paarsgewyse belynings te produseer deur die k-tuple-metode te gebruik Dan word die rye saamgevoeg deur die mBed-metode te gebruik. Dit word gevolg deur die k-beteken groeperingsmetode. Die gidsboom word volgende met die UPGMA-metode gebou.
